Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
WIPF3A6NGB9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms