Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LINC00312Q9Y6C7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms