Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SNX8Q9Y5X2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms