Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMED7Q9Y3B3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms