Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRG3Q9Y2Y8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRG3Q9Y2Y8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms