Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THRAP3Q9Y2W1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms