Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HIF3AQ9Y2N7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms