Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NINLQ9Y2I6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms