Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED23Q9ULK4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms