Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PHF11Q9UIL8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms