Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SCN11AQ9UI33 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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