Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CFDP1Q9UEE9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms