Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIP2Q9UDT6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms