Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NKX1-2Q9UD57 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms