Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTSFQ9UBX1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms