Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF7Q9UBF6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms