Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL9Q9P2J3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms