Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IGSF9Q9P2J2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGSF9Q9P2J2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms