Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SH3BP4Q9P0V3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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