Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EHD3Q9NZN3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms