Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS1Q9NYS0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms