Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK1Q9NYA1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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