Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLCO1B3Q9NPD5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms