Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A4GALTQ9NPC4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms