Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC52A2Q9HAB3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms