Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CEP44Q9C0F1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms