Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NSD3Q9BZ95 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NSD3Q9BZ95 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms