Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SNHG12Q9BXW3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms