Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCP2Q9BX26 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms