Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUR4

WRAP53, Telomerase Cajal body protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRAP53Q9BUR4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
WRAP53Q9BUR4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms