Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NICN1Q9BSH3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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