Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM175Q9BSA9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms