Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SEC22CQ9BRL7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEC22CQ9BRL7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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