Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHOXF2Q9BQY4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms