Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FYCO1Q9BQS8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FYCO1Q9BQS8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms