Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
BPIFA3Q9BQP9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BPIFA3Q9BQP9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms