Protein–RNA interactions for Protein: Q99259

GAD1, Glutamate decarboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAD1Q99259 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAD1Q99259 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms