Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCNX1Q96RV3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCNX1Q96RV3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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