Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRAPPC9Q96Q05 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms