Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CNBD2Q96M20 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CNBD2Q96M20 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms