Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf72Q96LT7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms