Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP47Q96K76 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP47Q96K76 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms