Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTV1Q96GA3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTV1Q96GA3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms