Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms