Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SMIM12Q96EX1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms