Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RNF183Q96D59 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms