Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1Q96CG8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1Q96CG8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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