Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKD2Q969F2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms