Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms