Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNRF4Q8WWF5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNRF4Q8WWF5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms